李某与A公司签订劳动合同,担任销售经理一职,劳动合同违约条款中约定未完成原销售计划所产生的亏损由李某承担,以现金的形式从李某工资中扣除。A公司相关规定载明,“员工当天突发疾病需要请假的,需由本人或委托家属于当天9时以前电话向上一级领导报备并系统内提交《请假申请单》,正常上班当天钉钉系统内上传医院证明”。后公司因李某未经审批先行休假,且未完成原销售计划为由,扣发了李某的应发工资,免去销售经理一职。李某不服A公司的决定遂申请劳动仲裁,请求A公司返还扣发的工资并支付赔偿金。仲裁裁决支持了李某的请求,A公司对此不服,诉至法院。法院判决A公司系违法解除劳动合同,向李某支付被扣发的工资并支付赔偿金。
结合材料,运用《法律与生活》的相关知识,说明法院作出上述判决的依据和意义。